RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464313.1

PTPN12-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 4

Gene PTPN12, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-210	ENST00000464313	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	KCNA3	P22001	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CD38	P28907	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	LRPAP1	P30533	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	DGKE	P52429	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PRKAG1	P54619	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313		A0A087WZ62	844 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	THAP12	O43422	761 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	RASAL1	O95294	804 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	NDST3	O95803	873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	A1BG	P04217	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CHRM2	P08172	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SRGN	P10124	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	HTR3A	P46098	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CPT1A	P50416	773 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CLCN2	P51788	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SATB1	Q01826	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	BIRC2	Q13490	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	E2F2	Q14209	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313		Q6YL49	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	LNX2	Q8N448	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-210	ENST00000464313	CCP110	O43303	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	PIAS2	O75928	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	FGF18	O76093	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	STK3	Q13188	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	NPY5R	Q15761	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	INSC	Q1MX18	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	ICE2	Q659A1	982 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-210	ENST00000464313	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms