RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ATG13O75143 517 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ATP2C2O75185 946 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RALAP11233 206 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CD19P15391 556 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 GPR15P49685 360 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CCR3P51677 355 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 NRLP54845 237 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MTF1Q14872 753 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ANGPT1Q15389 498 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CAMK4Q16566 473 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TXNDC8Q6A555 127 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 GAREM2Q75VX8 874 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ADSSL1Q8N142 457 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF516Q92618 1163 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MYRFLQ96LU7 910 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 VWA8A3KMH1 1905 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 VNN2O95498 520 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ADH1CP00326 375 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SLC5A3P53794 718 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CDH8P55286 799 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MAP3K7CLP57077 242 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 NHLH1Q02575 133 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF394Q53GI3 561 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 HECTD3Q5T447 861 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MLKLQ8NB16 471 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CXorf38Q8TB03 319 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TAS1R2Q8TE23 839 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 FOXQ1Q9C009 403 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TCHHQ07283 1943 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TRIP11Q15643 1979 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CLDN5O00501 218 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 P4HA2O15460 535 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 VNN1O95497 513 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 F11P03951 625 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 CCDC130P13994 396 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 FCARP24071 287 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ASPAP45381 313 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 PSEN1P49768 467 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TAF10Q12962 218 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RUNX3Q13761 415 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 STILQ15468 1287 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SGO2Q562F6 1265 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 IER5LQ5T953 404 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 PRSS33Q8NF86 280 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TTC8Q8TAM2 541 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.4 ms