RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 WHRNQ9P202 907 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 GULP1Q9UBP9 304 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 HIVEP1P15822 2718 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 EYA2O00167 538 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 CBFA2T2O43439 604 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 VAMP4O75379 141 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 RFPL2O75678 378 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRNB1P11230 501 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP2R1AP30153 589 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-203ENST00000459697 CLCN4P51793 760 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPK6Q16659 721 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-203ENST00000459697 LGI4Q8N135 537 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-203ENST00000459697 MOCOSQ96EN8 888 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 MTA3Q9BTC8 594 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBP1Q9H171 429 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-203ENST00000459697 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-203ENST00000459697 OPHN1O60890 802 aa5.46□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 PAMP19021 973 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 GABPAQ06546 454 aa5.46□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC32Q14392 662 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 C2orf27AQ580R0 203 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 WWC2Q6AWC2 1192 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 SEPT14Q6ZU15 432 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM124AQ86V42 546 aa5.46□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 MIGA1Q8NAN2 632 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 NXPE2Q96DL1 559 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM169Q96HH4 297 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 SETD4Q9NVD3 440 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 PIAS3Q9Y6X2 628 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-203ENST00000459697 EML5Q05BV3 1969 aa5.45□□□□□ -1.54
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