RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 EML3Q32P44 896 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 UNC13DQ70J99 1090 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6B3Q8NGW1 331 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF516Q92618 1163 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP2A3Q93084 1043 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SNX21Q969T3 373 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA17Q96L03 361 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00597Q9H2U6 94 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC39A2Q9NP94 309 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHA7Q9UN72 937 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE4BO95155 1302 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 F8VP50 259 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 TACC1O75410 805 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 RPP40O75818 363 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CLSTN1O94985 981 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CASP4P49662 377 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNA2D1P54289 1103 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 MYL6P60660 151 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 TRPC3Q13507 836 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CSRP2Q16527 193 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 BMT2Q1RMZ1 405 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR72Q3MJ13 1102 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 RESP18Q5W5W9 173 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR23CQ6ZRP0 262 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 KBTBD6Q86V97 674 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 NETO1Q8TDF5 533 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 GAB3Q8WWW8 586 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CD101Q93033 1021 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 EXOC4Q96A65 974 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 HHIPQ96QV1 700 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 RTKNQ9BST9 563 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SMPD4Q9NXE4 827 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 DENND4CQ5VZ89 1909 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF840PA6NDX5 716 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MXQ7 604 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 LEFTY2O00292 366 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN5O00501 218 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM66O15016 1216 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 AXIN1O15169 862 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 GDF9O60383 454 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 EXOC3O60645 756 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PHACTR2O75167 634 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 F13A1P00488 732 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ABL1P00519 1130 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC192P0DO97 292 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE6CP51160 858 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ZXDBP98169 803 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 TAF10Q12962 218 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 NR1H3Q13133 447 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMD2Q13200 908 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 BIRC3Q13489 604 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC6Q16204 474 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 HSCBQ8IWL3 235 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHO2Q8TD55 490 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ELMO3Q96BJ8 720 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 C8orf48Q96LL4 319 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP295NLQ96MC4 621 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 TTLL2Q9BWV7 592 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 XYLT2Q9H1B5 865 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 OBSL1O75147 1896 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC30A4O14863 429 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 NFATC1O95644 943 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM163BP0C2L3 166 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 RAP1GAPP47736 663 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 CDH8P55286 799 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PKP1Q13835 747 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms