RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-204ENST00000443667 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 GAREM1Q9H706 876 aa9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TMEM131Q92545 1883 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 C2orf78A6NCI8 922 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CCDC169A6NNP5 214 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CILPO75339 1184 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 KAT7O95251 611 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 NFATC1O95644 943 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CYP17A1P05093 508 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CXCL8P10145 99 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 MCF2P10911 925 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TYMPP19971 482 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 LRPAP1P30533 357 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SCRN1Q12765 414 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 LY6DQ14210 128 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CALCRLQ16602 461 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 LRRC15Q8TF66 581 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 IFT74Q96LB3 600 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SENP8Q96LD8 212 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 PNKPQ96T60 521 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 KIF2CQ99661 725 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TCHHQ07283 1943 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CAPN8A6NHC0 703 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 MYMKA6NI61 221 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 BTBD18B2RXH4 712 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 B8ZZF3 427 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 WNT7AO00755 349 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SLC28A2O43868 658 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 DEXIO95424 95 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 APODP05090 189 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 USP17L7P0C7H9 530 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ODC1P11926 461 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 GNSP15586 552 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 FECHP22830 423 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 PROZP22891 400 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ZXDBP98169 803 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 BNC1Q01954 994 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 KRT32Q14532 448 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 GALNT17Q6IS24 598 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 NXPE2Q96DL1 559 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 AK5Q9Y6K8 562 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 STK36Q9NRP7 1315 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 MYLKQ15746 1914 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 NDUFS2O75306 463 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 HOXB2P14652 356 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 NDUFV2P19404 249 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 MATKP42679 507 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 PEX3P56589 373 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 LILRA4P59901 499 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 RESTQ13127 1097 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 DHCR24Q15392 516 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 DDR2Q16832 855 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 HLA-BQ31612 363 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 COLEC12Q5KU26 742 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SPATA18Q8TC71 538 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 CDC6Q99741 560 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TRIM4Q9C037 500 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TMEM206Q9H813 350 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 GCNT4Q9P109 453 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 SCN1AP35498 2009 aa9.47□□□□□ -0.89
PDZK1-204ENST00000443667 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms