RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443509.6

PRUNE2-208, Transcript of prune homolog 2, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PRUNE2, Length 12,356 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRUNE2-208	ENST00000443509	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	AFF2	P51816	1311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MYL4	P12829	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	BLMH	Q13867	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	HLF	Q16534	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MED15	Q96RN5	788 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	BUB1	O43683	1085 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PTPN4	P29074	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	FDFT1	P37268	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MAPK7	Q13164	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	EPAS1	Q99814	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	MEIS1	O00470	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADCY6	O43306	1168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRIM23	P36406	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ABHD2	P08910	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYP2C9	P11712	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NAMPT	P43490	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	KRT17	Q04695	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DLG3	Q92796	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NMT2	O60551	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	RARG	P13631	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ITGA1	P56199	1179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TAF12	Q16514	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	ECE2	O60344	883 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	BRAF	P15056	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRIP10	Q15642	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	PGM2	Q96G03	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRUNE2-208	ENST00000443509	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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