RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 LRRN2O75325 713 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NOL4O94818 638 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 OAZ2O95190 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ASNSP08243 561 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM153BP0C7A2 387 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CSF2RAP15509 400 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UBA7P41226 1012 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM65Q6PJ69 517 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 OR8H3Q8N146 312 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BBS5Q8N3I7 341 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA8Q8TAA3 256 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PIGKQ92643 395 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 THRSPQ92748 146 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 VPS33AQ96AX1 596 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GCNAQ96QF7 691 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM50BQ9Y247 325 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 K7EPI3 171 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 AP5Z1O43299 807 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ECE2O60344 883 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KCNH1O95259 989 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ITGA2P17301 1181 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA2P43356 314 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KCNJ8Q15842 424 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL26Q53HC5 615 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BEST2Q8NFU1 509 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NCOA7Q8NI08 942 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP3Q96P20 1036 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEE1Q9HCI5 957 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 VPS45Q9NRW7 570 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MTRRQ9UBK8 725 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087WWV3 80 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 F8W8V4 182 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1BO75688 479 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TGDSO95455 350 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PSKH1P11801 424 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CDH1P12830 882 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PDE1AP54750 535 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 STILQ15468 1287 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 Q3C1V9 767 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ERAP2Q6P179 960 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CYP20A1Q6UW02 462 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ELMOD1Q8N336 334 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TNFRSF25Q93038 417 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SAMD11Q96NU1 681 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BBS4Q96RK4 519 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 WWP1Q9H0M0 922 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ING4Q9UNL4 249 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 AFF2P51816 1311 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HFM1A2PYH4 1435 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL8A6PVC2 850 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UBXN8O00124 270 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 USP1O94782 785 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NCAM1P13591 858 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HOXC8P31273 242 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB5P36952 375 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 STAT3P40763 770 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NSFP46459 744 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ASMTP46597 345 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ENTPD1P49961 510 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 COPAP53621 1224 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 RAB25P57735 213 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BFSP2Q13515 415 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CAMK2BQ13554 666 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms