RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 C2orf78A6NCI8 922 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 PSMA7O14818 248 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ABL1P00519 1130 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC130P13994 396 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CD58P19256 250 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 MXI1P50539 228 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 KRT39Q6A163 491 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 FAM35AQ86V20 835 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf210Q8IVY1 113 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SLC22A12Q96S37 553 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 OSBPL6Q9BZF3 934 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 EHD2Q9NZN4 543 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SHISA7A6NL88 538 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 USP17L7P0C7H9 530 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ENPEPQ07075 957 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 KCNK16Q96T55 309 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 GKN1Q9NS71 199 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 KRT82Q9NSB4 513 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 FAM49BQ9NUQ9 324 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 GREB1Q4ZG55 1949 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 STX10O60499 249 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CD44P16070 742 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 GTF2H1P32780 548 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 PLCB2Q00722 1185 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC63Q05C16 580 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CEP295NLQ96MC4 621 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 NIF3L1Q9GZT8 377 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 KIF9Q9HAQ2 790 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 AP1G2O75843 785 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM68Q6AZZ1 485 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 FRMD5Q7Z6J6 570 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 UNC93AQ86WB7 457 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 C12orf29Q8N999 325 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SLC2A14Q8TDB8 520 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SEMA4DQ92854 862 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SMARCD1Q96GM5 515 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CACNA1HO95180 2353 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SOBPA7XYQ1 873 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 LAMTOR5O43504 91 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 HDCP19113 662 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ADORA2BP29275 332 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 TAF10Q12962 218 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 PAQR9Q6ZVX9 377 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 FUKQ8N0W3 1084 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 NUP93Q8N1F7 819 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 FBXL13Q8NEE6 735 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 RIN3Q8TB24 985 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 TTLL2Q9BWV7 592 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 EBF3Q9H4W6 596 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SLITRK1Q96PX8 696 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 TWNKQ96RR1 684 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 LMAN1LQ9HAT1 526 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CYP3A43Q9HB55 503 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 RAB20Q9NX57 234 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CTNND2Q9UQB3 1225 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 YWHAQP27348 245 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 UBE2HP62256 183 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CAMK4Q16566 473 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CBWD6Q4V339 395 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF394Q53GI3 561 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 WDR44Q5JSH3 913 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CBWD3Q5JTY5 395 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CBWD5Q5RIA9 395 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CRYBG2Q8N1P7 616 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 NELFBQ8WX92 580 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO32Q969P5 355 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CLDN23Q96B33 292 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 NT5C1AQ9BXI3 368 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 GCNT4Q9P109 453 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF840PA6NDX5 716 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 BMP6P22004 513 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CTHP32929 405 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R2P41236 205 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 MAGEA9P43362 315 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 PDE6CP51160 858 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 MAP3K7CLP57077 242 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 INCA1Q0VD86 236 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 MTF1Q14872 753 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC40Q4G0X9 1142 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SCAMP5Q8TAC9 235 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 SH3RF2Q8TEC5 729 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 JAKMIP2Q96AA8 810 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-210ENST00000440825 MSANTD3Q96H12 275 aa29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms