RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZNX1 250 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HIPK4Q8NE63 616 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GJA10Q969M2 543 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A14Q9HCY8 104 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SELENONQ9NZV5 590 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BSA7 217 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FBP2O00757 339 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC37A4O43826 429 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL2P10916 166 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT4P19013 534 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA4P43358 317 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CASP4P49662 377 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CASP5P51878 434 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL4CP56559 192 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCB3Q01970 1234 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 AOC3Q16853 763 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -11e-6■■■□□ 19.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC19Q9H756 370 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK13Q9HB14 408 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CD209Q9NNX6 404 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ACP6Q9NPH0 428 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM260Q9NX78 707 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 APPL1Q9UKG1 709 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SMCO2A6NFE2 343 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MEI4A8MW99 385 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf81C9J6K1 198 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8RI6L899 631 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TYROBPO43914 113 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRN2O75325 713 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP3O75969 853 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TDP2O95551 362 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH2P05091 517 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PMLP29590 882 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GYG1P46976 350 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HDAC4P56524 1084 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PNMA1Q8ND90 353 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCG4Q9H172 646 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 E9PMD0 336 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP6O75344 327 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PIAS1O75925 651 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SNHG28P0DPA3 235 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ENTPD1P49961 510 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TLR1Q15399 786 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 IYDQ6PHW0 289 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TMC7Q7Z402 723 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 APPL2Q8NEU8 664 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GPAMQ9HCL2 828 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms