RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VPS53Q5VIR6 699 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 METTL7BQ6UX53 244 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSPH3Q86UC2 560 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VPS52Q8N1B4 723 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC43Q8N309 656 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GLG1Q92896 1179 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NACC1Q96RE7 527 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBK1Q9UHD2 729 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB23Q9ULC3 237 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUP205Q92621 2012 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DENND3A2RUS2 1198 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHISA7A6NL88 538 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANHXE9PGG2 379 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H0Y3Z8 333 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFPL2O75678 378 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GJB6O95452 261 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNHG28P0DPA3 235 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLCG1P19174 1290 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GUCY2CP25092 1073 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXD12P35452 270 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRK6P43250 576 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRPC1P48995 793 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLCN4P51793 760 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LIMK1P53667 647 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NLRP12P59046 1061 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPP1Q00013 466 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADCY1Q08828 1119 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RTL10Q7L3V2 364 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FGF14Q92915 247 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM63Q969Q1 353 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BORCS6Q96GS4 357 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM210AQ96ND0 272 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYL10Q9BUA6 226 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGS18Q9NS28 235 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRGBPQ9NV56 204 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GMIPQ9P107 970 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDP2Q9P2J9 529 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GINS2Q9Y248 185 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACNA1EQ15878 2313 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GFPT2O94808 682 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPPPO94811 219 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXO21O94952 628 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DLGAP3O95886 979 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRB1P04280 392 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms