RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 USP18Q9UMW8 372 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PIAS1O75925 651 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 HMGCRP04035 888 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ITGAVP06756 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PLCB3Q01970 1234 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 IFT88Q13099 833 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZBTB6Q15916 424 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CCL14Q16627 93 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MSS51Q4VC12 460 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.071e-9■■■□□ 15.9
RBM39-212ENST00000429968 SERPINB12Q96P63 405 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 APOL6Q9BWW8 343 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.64□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CETN2P41208 172 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MYO1EQ12965 1108 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PKDCCQ504Y2 493 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 BBS12Q6ZW61 710 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZNF410Q86VK4 478 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RELL1Q8IUW5 271 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RNF39Q9H2S5 420 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 KLK14Q9P0G3 267 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 HTTP42858 3142 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TMEM120BA0PK00 339 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 F2P00734 622 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SPTLC1O15269 473 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RECQL4O94761 1208 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 KRT7P08729 469 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 FGFR1P11362 822 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MAGEA9P43362 315 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ATP11AP98196 1134 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SLC20A2Q08357 652 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 KCTD6Q8NC69 237 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CPT1BQ92523 772 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CALN1Q9BXU9 219 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 A6NJR5 290 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TREHO43280 583 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 TMEM63AO94886 807 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 MAP3K6O95382 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GPD1P21695 349 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 BEX3Q00994 111 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 LMNB2Q03252 620 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 GPR162Q16538 588 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 CA9Q16790 459 aa14.62□□□□□ -0.07
RBM39-212ENST00000429968 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms