RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PDXK	O00764	312 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ATIC	P31939	592 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	AVPR1A	P37288	418 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SYK	P43405	635 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP4	P49662	377 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFA8	P51970	172 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	VSTM1	Q6UX27	236 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	RIN3	Q8TB24	985 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PCED1B	Q96HM7	432 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA17	Q96L03	361 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL26	Q9Y258	94 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PQ27	194 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PQ64	194 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PQD8	194 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PDGFRB	P09619	1106 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MYL6	P60660	151 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TNK2	Q07912	1038 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CCIN	Q13939	588 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PON2	Q15165	354 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	IL31	Q6EBC2	164 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC8	Q8TAM2	541 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TDP1	Q9NUW8	608 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	RHOBTB3	O94955	611 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR29	P0C7W0	189 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	BDNF	P23560	247 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	LIMK1	P53667	647 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	AP3M2	P53677	418 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TNNC1	P63316	161 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPC3	Q13507	836 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	LOXL4	Q96JB6	756 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	HPS4	Q9NQG7	708 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TM4SF5	O14894	197 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	AXIN1	O15169	862 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	NR3C1	P04150	777 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXC13	P31276	330 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	DPYD	Q12882	1025 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX25	Q9H3E2	840 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	GKN1	Q9NS71	199 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM66	O15016	1216 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	VNN1	O95497	513 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF806	P0C7X5	589 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	GRIK1	P39086	918 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	DLG4	P78352	724 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP27A1	Q02318	531 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CHFR	Q96EP1	664 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A12	Q96S37	553 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	GCNT4	Q9P109	453 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PHACTR2	O75167	634 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	TCF3	P15923	654 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNA4	P22459	653 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	PML	P29590	882 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	USP46	P62068	366 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	USP4	Q13107	963 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	RUNX3	Q13761	415 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NCOA4	Q13772	614 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF77	Q15935	545 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MRPL28-203	ENST00000429738	NFIL3	Q16649	462 aa		18.89	■□□□□ 0.61

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