RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 AURKCQ9UQB9 309 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM86B1E9PN63 330 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 INSRRP14616 1297 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CDH18Q13634 790 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CHRM3P20309 590 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 PLA2G4AP47712 749 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ICE2Q659A1 982 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 FBXO32Q969P5 355 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 DEPDC5O75140 1603 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 RHOBTB1O94844 696 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 C2CD6Q53TS8 623 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ZPBP2Q6X784 338 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 RFX8Q6ZV50 586 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 F5H5T6 163 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CCNG2Q16589 344 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 MRIQ9BWK5 157 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 H0Y626 953 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 FAXCQ5TGI0 409 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CPB2Q96IY4 423 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SPATA17Q96L03 361 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 KRT72Q14CN4 511 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ASB7Q9H672 318 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 VTA1Q9NP79 307 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 USP18Q9UMW8 372 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 LONP2Q86WA8 852 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 OLFM3Q96PB7 478 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CRLS1Q9UJA2 301 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 PPLO60437 1756 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SOAT2O75908 522 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CXCL8P10145 99 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 GCNT1Q02742 428 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CHI3L2Q15782 390 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SRLQ86TD4 932 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 GLRA3O75311 464 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP3A4P08684 503 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 PTGISQ16647 500 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 C2orf81A6NN90 581 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 HOXC6P09630 235 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 SEPT8Q92599 483 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 PNKPQ96T60 521 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 OSMRQ99650 979 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 INTS13Q9NVM9 706 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 GID8Q9NWU2 228 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CPA4Q9UI42 421 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 TIMM44O43615 452 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 ADCK2Q7Z695 626 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 MIB1Q86YT6 1006 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 REPS2Q8NFH8 660 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-203ENST00000409212 TAGAPQ8N103 731 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms