RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207		F8VP50	259 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207		H0Y858	1186 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CD72	P21854	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CCNE1	P24864	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	MAGEA9	P43362	315 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	PPP3CC	P48454	512 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	MXI1	P50539	228 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	PDE6C	P51160	858 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	WDR44	Q5JSH3	913 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CLDN5	O00501	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	PFKL	P17858	780 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ASPA	P45381	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	NDST1	P52848	882 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FAM3C	Q92520	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	MSANTD3	Q96H12	275 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55	9e-7	■■■■■ 105.8
SETD4-204	ENST00000399207	RAB20	Q9NX57	234 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	OBSL1	O75147	1896 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	BIN1	O00499	593 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ABL1	P00519	1130 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CKM	P06732	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	HDC	P19113	662 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ANGPT1	Q15389	498 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	NCAN	O14594	1321 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	ARNTL	O00327	626 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TADA3	O75528	432 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	AP1G2	O75843	785 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	CD58	P19256	250 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	YWHAQ	P27348	245 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	AMPD2	Q01433	879 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	INCA1	Q0VD86	236 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	TAF10	Q12962	218 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SETD4-204	ENST00000399207	MORC3	Q14149	939 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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