RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GRIK1P39086 918 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 VAMP7P51809 220 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CDH8P55286 799 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 STIM1Q13586 685 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 MON1AQ86VX9 555 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TAF4BQ92750 862 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN23Q96B33 292 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 MSANTD3Q96H12 275 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA17Q96L03 361 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GSDMAQ96QA5 445 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NELL2Q99435 816 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TDP1Q9NUW8 608 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 EHD2Q9NZN4 543 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CCL26Q9Y258 94 aa8.16□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf78A6NCI8 922 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PRR23AA6NEV1 266 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 LAMTOR5O43504 91 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 USP17L7P0C7H9 530 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CCNE1P24864 410 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CTHP32929 405 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TIE1P35590 1138 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ASPAP45381 313 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SOX9P48436 509 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GCLMP48507 274 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CACNA2D1P54289 1103 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 USP46P62068 366 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ENPEPQ07075 957 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TNK2Q07912 1038 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM9Q13443 819 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SV2AQ7L0J3 742 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TTC8Q8TAM2 541 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 FAM3CQ92520 227 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCE1Q969G3 411 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TNIP3Q96KP6 325 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf48Q96LL4 319 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A12Q96S37 553 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SDCBP2Q9H190 292 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.15□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN5O00501 218 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CETN3O15182 167 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SP9P0CG40 484 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PRCPP42785 496 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 MXI1P50539 228 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PDE6CP51160 858 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 NDST1P52848 882 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PPP3CAQ08209 521 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 USP4Q13107 963 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 MTAPQ13126 283 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ORC1Q13415 861 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 FZD5Q13467 585 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC32Q14392 662 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 MTF1Q14872 753 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF77Q15935 545 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT1Q86TX2 421 aa8.14□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 FAM35AQ86V20 835 aa8.14□□□□□ -1.11
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