RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 ITM2BQ9Y287 266 aa21.89■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 USP20Q9Y2K6 914 aa21.89■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 AIM2O14862 343 aa21.88■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 RRM1P23921 792 aa21.88■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.88■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.88■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 EMC1Q8N766 993 aa21.87■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 SLC11A2P49281 568 aa21.86■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 INPP5AQ14642 412 aa21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 BCAT1P54687 386 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 RRM2BQ7LG56 351 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-201ENST00000361125 TMEM169Q96HH4 297 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.85■■□□□ 1.09
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