RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 PSMD14O00487 310 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FIBPO43427 364 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ECE2O60344 883 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PRAMEF4O60810 478 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 XBP1P17861 261 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KRT9P35527 623 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 STAT5AP42229 794 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SLC6A9P48067 706 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 NKX3-2P78367 333 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FOXO4P98177 505 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 GRAPQ13588 217 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PTK2BQ14289 1009 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SPARCL1Q14515 664 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 STILQ15468 1287 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SUSD4Q5VX71 490 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SP8Q8IXZ3 490 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SNX33Q8WV41 574 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ERP27Q96DN0 273 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PWWP2AQ96N64 755 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SOX7Q9BT81 388 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TRIM17Q9Y577 477 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 AREL1O15033 823 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 ARHGAP6O43182 974 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 BAIAP3O94812 1187 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 LY86O95711 162 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CD4P01730 458 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 MYL4P12829 197 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 PRDX5P30044 214 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 THBS2P35442 1172 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 ARFIP2P53365 341 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CD69Q07108 199 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 MST1LQ2TV78 715 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 KANK2Q63ZY3 851 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 RNF44Q7L0R7 432 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 PROSER1Q86XN7 944 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 ZNF480Q8WV37 535 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CDCA5Q96FF9 252 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 ERO1AQ96HE7 468 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 DPH1Q9BZG8 443 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 BCO1Q9HAY6 547 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CLCA1A8K7I4 914 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 PODXLO00592 558 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 NTSR2O95665 410 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 MT-ND5P03915 603 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 CAPN3P20807 821 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 KCNJ5P48544 419 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 SOX8P57073 446 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 FZD5Q13467 585 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 DCTN1Q14203 1278 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 UBE3CQ15386 1083 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 TOMM20Q15388 145 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-201ENST00000358813 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms