RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 MYRFLQ96LU7 910 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 UBXN6Q9BZV1 441 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM30AQ9NV96 361 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 COMMD8Q9NX08 183 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 MED7O43513 233 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 TPM3P06753 285 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NPR3P17342 541 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K7CLP57077 242 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 PTK2Q05397 1052 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 PRSS36Q5K4E3 855 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC20AQ6ZU45 233 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 TMC8Q8IU68 726 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FAM71AQ8IYT1 594 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NUP93Q8N1F7 819 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 TFAP2BQ92481 460 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 PNPLA8Q9NP80 782 aa28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 O00370 1275 aa28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 BEST1O76090 585 aa28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CDC25CP30307 473 aa28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ZMIZ2Q8NF64 920 aa28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 IFNKQ9P0W0 207 aa28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN16Q9UKR8 245 aa28.32■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 MYO10Q9HD67 2058 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CYP26A1O43174 497 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GNA15P30679 374 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 BCAT1P54687 386 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 MTMR3Q13615 1198 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GCNAQ96QF7 691 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 SPAG5Q96R06 1193 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GPR88Q9GZN0 384 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 PATJQ8NI35 1801 aa28.31■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 UNC80Q8N2C7 3258 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 TNFRSF10BO14763 440 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CBFA2T2O43439 604 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 BRD2P25440 801 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GABRR2P28476 465 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CLCN1P35523 988 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 BST2Q10589 180 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 SLC5A9Q2M3M2 681 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ITFG1Q8TB96 612 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF606Q8WXB4 792 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 TTLL2Q9BWV7 592 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 NLRC4Q9NPP4 1024 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CDH7Q9ULB5 785 aa28.3■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 LOC730098B7Z3J9 87 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 F8VZ95 297 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 EPHB6O15197 1021 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 THAP12O43422 761 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CCR2P41597 374 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 PPP3CCP48454 512 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ZP2Q05996 745 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 MEA1Q16626 185 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GAREM2Q75VX8 874 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 FGF13Q92913 245 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 TCEAL4Q96EI5 215 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO44Q9H4M3 255 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 IL21Q9HBE4 155 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 GDE1Q9NZC3 331 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa28.29■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 F11P03951 625 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 SETSIPP0DME0 302 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 YWHAQP27348 245 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 STAT1P42224 750 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 JAM2P57087 298 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 TTC30AQ86WT1 665 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 STKLD1Q8NE28 680 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ZSWIM1Q9BR11 485 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 NUP58Q9BVL2 599 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ATXN3LQ9H3M9 355 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 IL37Q9NZH6 218 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ZMYM5Q9UJ78 669 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 OBSL1O75147 1896 aa28.28■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PRU2 124 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 HHLA1C9JL84 531 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 CALCAP01258 141 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 SOX5P35711 763 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 SLC5A3P53794 718 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 PKDCCQ504Y2 493 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 SHKBP1Q8TBC3 707 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 UBA3Q8TBC4 463 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 SLITRK1Q96PX8 696 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 MYADMQ96S97 322 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 EDEM3Q9BZQ6 932 aa28.27■■■□□ 2.12
CRIP1-201ENST00000330233 RBSNQ9H1K0 784 aa28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms