RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SCOCQ9UIL1 159 aa26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DGAT1O75907 488 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 POLE2P56282 527 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DLGAP5Q15398 846 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PCGF5Q86SE9 256 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 GATA6Q92908 595 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 FBXO40Q9UH90 709 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 RIPK3Q9Y572 518 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 KAT6AQ92794 2004 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PSMA2P25787 234 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 KRT72Q14CN4 511 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 NPNTQ6UXI9 565 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 UBR7Q8N806 425 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 MSTO1Q9BUK6 570 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 VCXQ9H320 206 aa26.44■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 LRCH4O75427 683 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CALB1P05937 261 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 WEE2P0C1S8 567 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 KITP10721 976 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 TNFSF9P41273 254 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CHSY1Q86X52 802 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PDIK1LQ8N165 341 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CYB561D2O14569 222 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 RGS20O76081 388 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC18P0CG32 403 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 GALNT15Q8N3T1 639 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CYTH2Q99418 400 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 RAD17O75943 681 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 USP1O94782 785 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 GHRHRQ02643 423 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SLC18A2Q05940 514 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SLC25A41Q8N5S1 370 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CGRRF1Q99675 332 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 TGDSO95455 350 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 YY1P25490 414 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 MYL6P60660 151 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 KDSRQ06136 332 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SLC44A1Q8WWI5 657 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 TUBB6Q9BUF5 446 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 STYXL1Q9Y6J8 313 aa26.42■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 MAP3K7O43318 606 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 KDELR1P24390 212 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ENPEPQ07075 957 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PANX3Q96QZ0 392 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DPYSL3Q14195 570 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 BBS12Q6ZW61 710 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 LRRN4Q8WUT4 740 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CFAP36Q96G28 342 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 WDR81Q562E7 1941 aa26.41■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GVG6 124 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CAPN14A8MX76 684 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 UGT1A9O60656 530 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 KCNA2P16389 499 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PTPN20Q4JDL3 420 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 C20orf27Q9GZN8 174 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 UGT1A7Q9HAW7 530 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 UGT1A10Q9HAW8 530 aa26.4■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 UGT1A8Q9HAW9 530 aa26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms