RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.5■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 HS6ST3Q8IZP7 471 aa23.5■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 C8orf48Q96LL4 319 aa23.5■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 MYO6Q9UM54 1294 aa23.5■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM66O15016 1216 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 MMEP08473 750 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SKILP12757 684 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 USP46P62068 366 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 NTHL1P78549 312 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 RTL10Q7L3V2 364 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 HHLA1C9JL84 531 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 MED7O43513 233 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ANXA13P27216 316 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 BCAT1P54687 386 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PSMG2Q969U7 264 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CORO1BQ9BR76 489 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PIDD1Q9HB75 910 aa23.49■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CHRNB2P17787 502 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 GPD2P43304 727 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 STILQ15468 1287 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ASIC2Q16515 512 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 GPR149Q86SP6 731 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PIGZQ86VD9 579 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 IQCDQ96DY2 449 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SPATA17Q96L03 361 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.48■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PIK3R2O00459 728 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 TNFRSF10BO14763 440 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 XYLBO75191 536 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 FERP16591 822 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 RGS7P49802 495 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PLD1Q13393 1074 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 VEPH1Q14D04 833 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PMF1Q6P1K2 205 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 DRC7Q8IY82 874 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SPC24Q8NBT2 197 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CD207Q9UJ71 328 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 MYH10P35580 1976 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC5A3P53794 718 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM14Q14142 442 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ELMOD1Q8N336 334 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.47■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PAPLNO95428 1278 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC8A3P57103 927 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 FMO1Q01740 532 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CDR2Q01850 454 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ITIH3Q06033 890 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 TAF12Q16514 161 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CES5AQ6NT32 575 aa23.46■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 MFAP3LO75121 409 aa23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 GABBR2O75899 941 aa23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 RHOP08100 348 aa23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 CCR2P41597 374 aa23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 HGSNATQ68CP4 663 aa23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 NUP93Q8N1F7 819 aa23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 LRRC3Q9BY71 257 aa23.45■■□□□ 1.35
SOHLH1-201ENST00000298466 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 SETSIPP0DME0 302 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 CSH1P0DML2 217 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 CSH2P0DML3 217 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 PTPN2P17706 415 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 TMC8Q8IU68 726 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 ASB3Q9Y575 518 aa23.45■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 TPM1P09493 284 aa23.44■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 GJA1P17302 382 aa23.44■■□□□ 1.34
SOHLH1-201ENST00000298466 PLA2G4AP47712 749 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms