RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261947.4

RNF130-201, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF130, Length 1,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-201ENST00000261947 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 STRIP2Q9ULQ0 834 aa28.85■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 E5RJQ4 531 aa28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 RB1P06400 928 aa28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 CYP2F1P24903 491 aa28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 RPL34P49207 117 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 ROR1Q01973 937 aa28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 RHOT2Q8IXI1 618 aa28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 HSFY1Q96LI6 401 aa28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 PIK3R2O00459 728 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 BUB1O43683 1085 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 LILRB3O75022 631 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 GABBR2O75899 941 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 TAP1Q03518 808 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 ATAD1Q8NBU5 361 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 SPPL3Q8TCT6 385 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 SAMD11Q96NU1 681 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 OSGEPQ9NPF4 335 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 CYLDQ9NQC7 956 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 WDR27A2RRH5 827 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 MTMR11A4FU01 709 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 PTPN14Q15678 1187 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 TMC7Q7Z402 723 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 XYLT1Q86Y38 959 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 TDHQ8IZJ6 230 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 MIS12Q9H081 205 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa28.83■■■□□ 2.21
RNF130-201ENST00000261947 LAMA3Q16787 3333 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ACADSBP45954 432 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 NOP2P46087 812 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 SNX16P57768 344 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ERVK-21P61565 698 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 TCEAL1Q15170 157 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 NYAP1Q6ZVC0 841 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 SPPL2BQ8TCT7 592 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 POF1BQ8WVV4 589 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 UBXN6Q9BZV1 441 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ABCB6Q9NP58 842 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 COG5Q9UP83 839 aa28.82■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 MOCS3O95396 460 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 VNN2O95498 520 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 GSCP56915 257 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 UBE3AQ05086 875 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 VSTM1Q6UX27 236 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 NUP85Q9BW27 656 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 PARVAQ9NVD7 372 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 FNIP2Q9P278 1114 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 WDR35Q9P2L0 1181 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 UVRAGQ9P2Y5 699 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 MSRAQ9UJ68 235 aa28.81■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 F8VP50 259 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 KIF5CO60282 957 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 DNAJB1P25685 340 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 GRIK1P39086 918 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 MAGEA11P43364 429 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ERVFC1P60507 584 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 CREMQ03060 361 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 MAMLD1Q13495 774 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 RAB30Q15771 203 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 TCF25Q9BQ70 676 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 RXFP1Q9HBX9 757 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 HHLA1C9JL84 531 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 CXCL14O95715 111 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 CA8P35219 290 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 SCUBE3Q8IX30 993 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 TTC9BQ8N6N2 239 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 C3orf20Q8ND61 904 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ZNF461Q8TAF7 563 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 PNPLA8Q9NP80 782 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 SCINQ9Y6U3 715 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 PATJQ8NI35 1801 aa28.8■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ABLIM3O94929 683 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 LCP1P13796 627 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ADCY1Q08828 1119 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 RAB33AQ14088 237 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 OR6B2Q6IFH4 312 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 SCN4BQ8IWT1 228 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 MCRS1Q96EZ8 462 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 CRISPLD1Q9H336 500 aa28.79■■■□□ 2.2
RNF130-201ENST00000261947 LRRC4Q9HBW1 653 aa28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms