RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 BASP1P80723 227 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 MDH1BQ5I0G3 518 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PORCNQ9H237 461 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 FETUBQ9UGM5 382 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 LRCH1Q9Y2L9 728 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 C2CD2Q9Y426 696 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 NPTXRO95502 500 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ASS1P00966 412 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ABCD1P33897 745 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SLC34A1Q06495 639 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 FBXO27Q8NI29 283 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 STMN2Q93045 179 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 NMUR2Q9GZQ4 415 aa28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 NDC80O14777 642 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 LSM8O95777 96 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 AMPD1P23109 780 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PTK7Q13308 1070 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 IRGCQ6NXR0 463 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 MTMR12Q9C0I1 747 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 AHCYL1O43865 530 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PIGRP01833 764 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PYGBP11216 843 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 TGFB2P61812 414 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 FAAP100Q0VG06 881 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ZBTB33Q86T24 672 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 KBTBD2Q8IY47 623 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 FAM71DQ8N9W8 422 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 JOSD2Q8TAC2 188 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ADGRA2Q96PE1 1338 aa28.29■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 FCHO1O14526 889 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 NAMPTP43490 491 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 BIRC2Q13490 618 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 NIPA2Q8N8Q9 360 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ABLIM1O14639 778 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 AP1G2O75843 785 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 APBA3O96018 575 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ETV4P43268 484 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SP2Q02086 613 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 OR52E8Q6IFG1 317 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ASB3Q9Y575 518 aa28.28■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 LRCH4O75427 683 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 STAM2O75886 525 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 FAM155BO75949 473 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PDIK1LQ8N165 341 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 MECRQ9BV79 373 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SYNCQ9H7C4 482 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 SKIP12755 728 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ELK3P41970 407 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 TAP1Q03518 808 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 PCSK1NQ9UHG2 260 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 KCNG1Q9UIX4 513 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 E7ESA3 106 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 EMC1Q8N766 993 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 FAM161BQ96MY7 647 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGEF4Q9NR80 690 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM149A-201ENST00000227065 KRT3P12035 628 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 KDELR1P24390 212 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 ARL2P36404 184 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 PGM1P36871 562 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 OCRLQ01968 901 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 AP1ARQ63HQ0 302 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 DENND1BQ6P3S1 775 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 BBS12Q6ZW61 710 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 POLNQ7Z5Q5 900 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 TCHPQ9BT92 498 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 VCXQ9H320 206 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 H3BRJ5 948 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 AVILO75366 819 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 KCNA3P22001 575 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 PTPN20Q4JDL3 420 aa28.26■■■□□ 2.11
FAM149A-201ENST00000227065 FOXB2Q5VYV0 432 aa28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms