RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052708.6

Ckap2l-201, Transcript of Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ckap2l, Length 3,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Skap2Q3UND0 358 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mxd4Q60948 209 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Oca2Q62052 833 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tbc1d12Q6A039 696 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gpsm1Q6IR34 673 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Uba3Q8C878 462 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Lrrc45Q8CIM1 670 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fam49bQ921M7 324 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fam212aQ9CX62 282 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 GOLGA7BQ9D428 167 aa9.51□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 PtprfA2A8L5 1898 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pex5O09012 639 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mybl1P51960 751 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Psmc1P62192 440 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Capza3P70190 299 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ccdc138Q0VF22 680 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Acsbg2Q2XU92 667 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 PostnQ62009 838 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tmem145Q8C4U2 746 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 B3galt6Q91Z92 325 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Smc6Q924W5 1097 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tmed5Q9CXE7 229 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cfap57Q9D180 1249 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 St6galnac4Q9R2B6 360 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Nfs1Q9Z1J3 459 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Szt2A2A9C3 3431 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zscan4dA7KBS4 506 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Myo1eE9Q634 1107 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Akr1b10G5E895 316 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gsg1l2M0QWL6 290 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Birc5O70201 140 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 AcrP23578 436 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Znf800Q0VEE6 662 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zscan4fQ3URS2 506 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tcf4Q60722 670 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ssxb10Q6XAR7 170 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zscan4cQ80VJ6 506 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tor4aQ8BH02 426 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Haus1Q8BHX1 278 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fam163bQ8BUM6 167 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 KyQ8C8H8 661 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tmprss4Q8VCA5 435 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Eps8l2Q99K30 729 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 NamptQ99KQ4 491 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mcrs1Q99L90 462 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Llcfc1Q9D9P8 108 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 IdeQ9JHR7 1019 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gfra4Q9JJT2 260 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Znf394Q9Z1D9 521 aa9.5□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dmp1O55188 503 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 P04214 136 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cyp2b9P12790 491 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 SftpdP50404 374 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mnat1P51949 309 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gspt2Q149F3 632 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Spout1Q3UHX9 385 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Naif1Q6PFD7 327 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Als2cr12Q8BVM7 383 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Iffo1Q8BXL9 562 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Slc13a4Q8BZ82 625 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Podxl2Q8CAE9 603 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Sept8Q8CHH9 429 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gpr37l1Q99JG2 481 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Acbd6Q9D061 282 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Net1Q9Z206 595 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 BC049352E9Q2Z6 85 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm11236J3QMS7 360 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 P01878 344 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 XlrP05531 208 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pde6bP23440 856 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 GstcdQ5RL51 634 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Arhgap44Q5SSM3 814 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zic5Q7TQ40 622 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Vat1lQ80TB8 417 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Smarcal1Q8BJL0 910 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Kank2Q8BX02 843 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mcoln2Q8K595 566 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 GhdcQ99J23 532 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Q9CQC3 228 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Med7Q9CZB6 233 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Armc9Q9D2I5 817 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Rasgef1cQ9D300 466 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 LrmdaQ9D9B4 229 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.9 ms