RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptchd4B9EKX1 904 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb3O54890 787 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt13P08730 437 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GaaP70699 953 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim43bP86448 445 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zswim6Q80TB7 1207 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SowahaQ8BLS7 548 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem145Q8C4U2 746 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uba3Q8C878 462 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ca9Q8VHB5 437 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Socs4Q91ZA6 436 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqcf1Q9D9K8 182 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa13.25□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FscbA1EGX6 1074 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf19bA2A7Q9 732 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5926E9PWJ8 236 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trove2O08848 538 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ets2P15037 468 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox5P52651 210 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam193bQ3U2K0 892 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orai2Q8BH10 250 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pi4kbQ8BKC8 816 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angel1Q8VCU0 667 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map4k3Q99JP0 894 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Setd6Q9CWY3 473 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mms19Q9D071 1031 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MlklQ9D2Y4 472 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mta2Q9R190 668 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp358E9Q8M1 571 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GnazO70443 355 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptgs2Q05769 604 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igsf9Q05BQ1 1179 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asprv1Q09PK2 339 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc39dQ0VF76 604 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnga4Q3UW12 575 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf4Q60722 670 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhdc10Q6PAR0 439 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddhd1Q80YA3 547 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdtc1Q80ZK9 677 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx42Q810A7 929 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PimregQ8BFY7 231 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap3m2Q8R2R9 418 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Caskin2Q8VHK1 1201 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Setd3Q91WC0 594 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snf8Q9CZ28 258 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fundc1Q9DB70 155 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DmgdhQ9DBT9 869 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim54Q9ERP3 366 aa13.24□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm27029A2A4P4 543 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lonrf2B2RT44 518 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc17E9PVB5 1198 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspyl1O88852 379 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CopeO89079 308 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnl1P36916 607 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grm1P97772 1199 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf10Q3UIW5 804 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grid1Q61627 1009 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc117Q6PB51 277 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdpoz2Q717B2 364 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1494Q8VGP8 315 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nt5c1bQ91YE9 573 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam49bQ921M7 324 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata31d1aE9QA35 1336 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdm15E9Q8T2 1174 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp212G3X8R7 492 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Banf1O54962 89 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrlP06879 226 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc160Q3UYG1 323 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrcpQ7TMR0 491 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dus1lQ8C2P3 475 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uba6Q8C7R4 1053 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B4galt3Q91YY2 395 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Leng1Q9DB98 261 aa13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5795E9PZN8 263 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10721J3QPJ9 223 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7995L7N2E4 160 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept4P28661 478 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxp2P58463 714 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SobpQ0P5V2 864 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dzip1lQ499E4 774 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp4Q61107 620 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GnsQ8BFR4 544 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpa1Q8BLA8 1125 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc3Q91YW3 504 aa13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms