RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TIP20	YGL145W	PAM16	P42949	149 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TIP20	YGL145W	YJL144W	P47009	104 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TIP20	YGL145W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TIP20	YGL145W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TIP20	YGL145W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TIP20	YGL145W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	INO4	P13902	151 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	CLB6	P32943	380 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YHR022C	P38763	256 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	NSE4	P43124	402 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	ELC1	Q03071	99 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	UBR1	P19812	1950 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	SAY1	P53324	424 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	PAU12	P53343	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
TIP20	YGL145W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	CYT2	Q00873	224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YHP1	Q04116	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YMR252C	Q04814	134 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	KIN28	P06242	306 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	PAU24	P38155	120 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	SWM2	P40342	146 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	DAD4	P69851	72 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	COX8	P04039	78 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YBL010C	P32788	280 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YEL067C	P39978	195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	DAD3	P69850	94 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	STT4	P37297	1900 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	PAU2	P32612	120 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	ECM31	P38122	312 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	PHS1	P40857	217 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	AIM11	P87275	137 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	TMA23	Q03525	211 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YCR050C	P25630	102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	UTR5	P32630	166 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	KEI1	Q06346	221 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	PRM7	Q12459	698 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	MRP17	P28778	131 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	MIX17	Q03667	156 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	FIT2	Q08906	153 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	FAB1	P34756	2278 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	COX9	P07255	59 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	SRB6	P32570	121 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YHL042W	P38729	150 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	GAT4	P40569	121 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	SNN1	P48232	102 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	ERG25	P53045	309 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	YML079W	Q03629	201 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TIP20	YGL145W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YKR045C	P36138	183 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YAL064W	P39711	94 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	MOB1	P40484	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	SAE3	P89114	91 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	HRT1	Q08273	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YOR385W	Q08909	290 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YGR269W	P40326	108 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	IRC19	Q07843	230 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	PCC1	Q3E833	88 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	MDM35	O60200	86 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	SPG1	P50088	95 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	TIM12	P32830	109 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	SFT2	P38166	215 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	FLX1	P40464	311 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	ZEO1	Q08245	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	DSE2	P38844	325 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	HUT1	Q12520	339 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	COX5B	P00425	151 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	GTT1	P40582	234 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	DAN1	P47178	298 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	ATP19	P81451	68 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	RPB11	P38902	120 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	EMC5	P40540	141 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	SCP1	Q08873	200 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	SOM1	Q05676	74 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TIP20	YGL145W	FYV5	P25585	152 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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