RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W DOG2P38773 246 aa3.65□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YIL012WP40551 113 aa3.65□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YML079WQ03629 201 aa3.65□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W YPR098CQ06089 161 aa3.65□□□□□ -1.82
PRD1YCL057W LIP2Q06005 328 aa3.65□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YPS1P32329 569 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W ECM14P38836 430 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W PET8P38921 284 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W SNU13P39990 126 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YER084WP40057 128 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YMR141CP40211 102 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W GON7P46984 123 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W SUR7P54003 302 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YDR391CQ04170 232 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W PAU7P39545 55 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W LST8P41318 303 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YAR1P46683 200 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YIL014C-AQ02598 104 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W GTO3Q04806 366 aa3.64□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W SNF11P38956 169 aa3.63□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W Q0144Q9ZZW2 109 aa3.63□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W DAL82P21705 255 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W APS1P35181 156 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W DAD4P69851 72 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W DGA1Q08650 418 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W HTL1Q9URQ5 78 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YKR032WP36127 104 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W CSH1P38287 376 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W ECO1P43605 281 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W HAL1Q01766 294 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W MRX11Q03079 207 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W MIX17Q03667 156 aa3.62□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W HFA1P32874 2273 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YCR023CP25351 611 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YBL071CP38185 102 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YGR018CP53211 109 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W PRM3Q08931 133 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YCR075W-AQ3E830 75 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W ISD11Q6Q560 94 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W INO4P13902 151 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W CPT1P17898 393 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W IGD1P43598 195 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W ELC1Q03071 99 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YMR103CQ04436 120 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W MSA1Q08471 629 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YOR029WQ12243 111 aa3.61□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W FPR2P32472 135 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YKL044WP36092 106 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W MRPL39P36533 70 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YPL073CP40323 161 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W PIR5P46999 287 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YDR042CQ03205 200 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W YLR296WQ05898 108 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W DAD1Q12248 94 aa3.6□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W OST2P46964 130 aa3.59□□□□□ -1.83
PRD1YCL057W VAR1P02381 398 aa3.59□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W UTH1P36135 365 aa3.59□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W GPI18P38211 433 aa3.59□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W ATX1P38636 73 aa3.59□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YEL067CP39978 195 aa3.59□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W SIP18P50263 79 aa3.59□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W HST4P53688 370 aa3.59□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W FMP27Q06179 2628 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YFL065CP43539 102 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YPS5P53057 165 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YPR203WQ08994 102 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W TRA1P38811 3744 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W RPL39P04650 51 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W IES6P32617 166 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YKR041WP36134 250 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YJL118WP47022 219 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa3.58□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YDL022C-AP0C5L6 82 aa3.57□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YER181CP40097 107 aa3.57□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YKR045CP36138 183 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YDR209CQ03480 137 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W SDH7Q04401 133 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YPL229WQ99395 206 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YOR304C-AO14468 76 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YHR213WP0CI67 198 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W HMRA2P0CY13 119 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YPL080CQ02826 108 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YPL261CQ08976 102 aa3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W DAL80P26343 269 aa3.55□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W YNR077CP53758 84 aa3.55□□□□□ -1.84
PRD1YCL057W UBC7Q02159 165 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 120.8 ms