RNA–Protein interactions for RNA: RPR1

RPR1, Transcript of RNA component of nuclear RNase P, yeast

Gene RPR1, Length 369 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPR1	RPR1	PHO23	P50947	330 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	GPI19	Q04082	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	MSK1	P32048	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	MRPS9	P38120	278 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	SHG1	P38337	142 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	CIN5	P40917	295 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	DCV1	P43595	202 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	UBC12	P52491	188 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	YGL088W	P53151	121 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	NAT3	Q06504	195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	SRP21	P32342	167 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	YBR209W	P38311	105 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	ATP14	Q12349	124 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	ZRT1	P32804	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	SRP14	P38985	146 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	RPC10	P40422	70 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	AIM19	P40502	157 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	GIM5	Q04493	163 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	CNB1	P25296	175 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	QRI5	P32344	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	PEX22	P39718	180 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	OST3	P48439	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPR1	RPR1	MRPL33	P20084	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	SDH8	P38345	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YER085C	P40058	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	DAD3	P69850	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	GTO3	Q04806	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YGR149W	P48236	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	CGR1	P53188	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	EOS1	P53938	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	MHR1	Q06630	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	SRB6	P32570	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	AIM29	P36154	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	HAC1	P41546	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	SDS23	P53172	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	DCN1	Q12395	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	ENV10	Q99382	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	GLO1	P50107	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	PAU7	P39545	55 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YER076C	P40049	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	PAU5	P43575	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	ZEO1	Q08245	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	LDS1	P31379	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YKL070W	P36087	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YKR032W	P36127	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YBR219C	P38317	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	HHO1	P53551	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YLR118C	Q12354	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPR1	RPR1	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	SNN1	P48232	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	YGL149W	P53116	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	ECM12	O13529	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
RPR1	RPR1	YIL024C	P40543	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	PHS1	P40857	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	PAM17	P36147	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	YEL008W	P40001	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	GTT1	P40582	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	YJR146W	P47174	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	POM33	Q12164	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	TRP1	P00912	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	YGL010W	P25338	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPR1	RPR1	BNS1	P50084	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms