RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	KPNA6	O60684	536 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TCF4	P15884	667 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	THPO	P40225	353 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CCT5	P48643	541 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	COPS2	P61201	443 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PTP4A2	Q12974	167 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	P3H4	Q92791	437 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PPEF2	O14830	753 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ADCY6	O43306	1168 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PPFIA2	O75334	1257 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MIP	P30301	263 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MORN1	Q5T089	497 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MGARP	Q8TDB4	240 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	DERA	Q9Y315	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RARG	P13631	454 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PPP2R2A	P63151	447 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PTK6	Q13882	451 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CYP1B1	Q16678	543 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	KYNU	Q16719	465 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	NME8	Q8N427	588 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	C9orf72	Q96LT7	481 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SH3GL2	Q99962	352 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TBK1	Q9UHD2	729 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC130	P13994	396 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FLT3LG	P49771	235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	IRAK1	P51617	712 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	OGDH	Q02218	1023 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	UBR7	Q8N806	425 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ACTL9	Q8TC94	416 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	KAT2B	Q92831	832 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	IPP	Q9Y573	584 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CYB561D2	O14569	222 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PTPRF	P10586	1907 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	BCAT1	P54687	386 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	BCAR1	P56945	870 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CENPU	Q71F23	418 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77

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