RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	PMM1	Q92871	262 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ALG2	Q9H553	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CEP72	Q9P209	647 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	BEST1	O76090	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CAVIN2	O95810	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT5	P13647	590 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	MTMR3	Q13615	1198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CD207	Q9UJ71	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CFH	P08603	1231 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	IL9	P15248	144 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	UCHL3	P15374	230 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ELF1	P32519	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	USP8	P40818	1118 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF132	P52740	706 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIO	O75962	3097 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634		F8VP50	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	MBTPS2	O43462	519 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TPM2	P07951	284 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM163B	P0C2L3	166 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CD19	P15391	556 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CCR2	P41597	374 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	NR1I3	Q14994	352 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	POTEH	Q6S545	545 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SHC3	Q92529	594 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TNIP3	Q96KP6	325 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	MED10	Q9BTT4	135 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	POMK	Q9H5K3	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	NOTCH4	Q99466	2003 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TULP2	O00295	520 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	CYP26A1	O43174	497 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	NCK2	O43639	380 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	LRG1	P02750	347 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	GJA1	P17302	382 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	SERPINB4	P48594	390 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	MFAP3	P55082	362 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	UBASH3A	P57075	661 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	USP46	P62068	366 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	TPM4	P67936	248 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SCARB2-222	ENST00000640634	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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