RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 ABCD1P33897 745 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TNFSF9P41273 254 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TRAPPC10P48553 1259 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ECM1Q16610 540 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 JADE1Q6IE81 842 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 SKAP1Q86WV1 359 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PGBD3Q8N328 593 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ALLCQ8N6M5 410 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 RLN3Q8WXF3 142 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 FAM212AQ96EL1 285 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 FNBP1Q96RU3 617 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CAPN10Q9HC96 672 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 C2CD2Q9Y426 696 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 LAMA5O15230 3695 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ANO9A1A5B4 782 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 E9PMD0 336 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PIRO00625 290 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGAP33O14559 1287 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ADH1CP00326 375 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 NFICP08651 508 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 OPRD1P41143 372 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PNPLA4P41247 253 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 NCKAP1LP55160 1127 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 RESTQ13127 1097 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PDIA5Q14554 519 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF174Q15697 407 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 NAXDQ8IW45 347 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 KCNN1Q92952 543 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 MYRFLQ96LU7 910 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 EHD2Q9NZN4 543 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 DKK4Q9UBT3 224 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 APC2O95996 2303 aa9.29□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PQD8 194 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 K7ENM7 598 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 LAD1O00515 517 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 FAM189A1O60320 539 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 DTNBO60941 627 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PIGRP01833 764 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CYP17A1P05093 508 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ADRB2P07550 413 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CD59P13987 128 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 GNSP15586 552 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CDR1P51861 262 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 MYL7Q01449 175 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CFAP221Q4G0U5 840 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 WSCD1Q658N2 575 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 STKLD1Q8NE28 680 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 MDM1Q8TC05 714 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 PNKPQ96T60 521 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ASB7Q9H672 318 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 RAXQ9Y2V3 346 aa9.28□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
HLA-B-257ENST00000640094 SFI1A8K8P3 1242 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 KPNA7A9QM74 516 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SGK1O00141 431 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SH3BP5O60239 455 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF217O75362 1048 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 KAT7O95251 611 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 HDCP19113 662 aa9.27□□□□□ -0.93
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