RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF677	Q86XU0	584 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	BSND	Q8WZ55	320 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	APOPT1	Q96IL0	206 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	RIT2	Q99578	217 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	ITGAV	P06756	1048 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	NPTX2	P47972	431 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	FAAP100	Q0VG06	881 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	PTK7	Q13308	1070 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	ITFG2	Q969R8	447 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	FBXL18	Q96ME1	805 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PMS1-222	ENST00000639501	MEI4	A8MW99	385 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TM7SF2	O76062	418 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	KAT6A	Q92794	2004 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	GNA15	P30679	374 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CDKN2B	P42772	138 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	MTMR2	Q13614	643 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CFAP157	Q5JU67	520 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM270	Q6UE05	265 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ACER1	Q8TDN7	264 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	MCEE	Q96PE7	176 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	HAPLN3	Q96S86	360 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PTPRJ	Q12913	1337 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501		A6NJR5	290 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	FAM155B	O75949	473 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	USP4	Q13107	963 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PALM2	Q8IXS6	379 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	OPTN	Q96CV9	577 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	COL20A1	Q9P218	1284 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SLX4	Q8IY92	1834 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501		E7ESA3	106 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	KIT	P10721	976 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	GTF2H1	P32780	548 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	AP2B1	P63010	937 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	HLA-DRA	P01903	254 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CCNF	P41002	786 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SLC18A2	Q05940	514 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	LSAMP	Q13449	338 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	POLI	Q9UNA4	740 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CIB2	O75838	187 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	NPR1	P16066	1061 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	YY1	P25490	414 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SFT2D3	Q587I9	215 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ACTL9	Q8TC94	416 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		21.42	■■□□□ 1.02

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