RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621590.4

C1orf141-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 141, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene C1orf141, Length 4,179 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C1orf141-208	ENST00000621590	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PPEF2	O14830	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PSMD10	O75832	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	MCM5	P33992	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SLC8A3	P57103	927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	STK38	Q15208	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	UGT8	Q16880	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	NFKBIE	O00221	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	MMP20	O60882	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	KRT14	P02533	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PDE6A	P16499	860 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	KCNJ4	P48050	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	CNGA2	Q16280	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	KYNU	Q16719	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	GAD1	Q99259	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	CLU	P10909	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	ITGA4	P13612	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	PSMA5	P28066	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	CHRNA3	P32297	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FMO1	Q01740	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FOXO1	Q12778	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	INPP5A	Q14642	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	SEPT8	Q92599	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
C1orf141-208	ENST00000621590	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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