RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619989.1

CCL3L3-203, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3L3, Length 784 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-203ENST00000619989 CCR2P41597 374 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 STKLD1Q8NE28 680 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 PSMG2Q969U7 264 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TNIP3Q96KP6 325 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 NT5C1BQ96P26 610 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 MED10Q9BTT4 135 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CBX8Q9HC52 389 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CDH7Q9ULB5 785 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CLDN5O00501 218 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 SERPINC1P01008 464 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CEBPBP17676 345 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 UNC93AQ86WB7 457 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 LEMD2Q8NC56 503 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 GCNT4Q9P109 453 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 A0A1W2PRU2 124 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 DCXO43602 365 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CSH1P0DML2 217 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CSH2P0DML3 217 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ALADP13716 330 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 GABRR2P28476 465 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 MAGEA11P43364 429 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 EPHA5P54756 1037 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 MTMR3Q13615 1198 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 KRT31Q15323 416 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ZNF394Q53GI3 561 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 VSTM1Q6UX27 236 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 LUZP1Q86V48 1076 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TMC8Q8IU68 726 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 C12orf29Q8N999 325 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TWNKQ96RR1 684 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ARID3AQ99856 593 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 LRRC3Q9BY71 257 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 VPS16Q9H269 839 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 KCNK12Q9HB15 430 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CISHQ9NSE2 258 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 NOTCH4Q99466 2003 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CILPO75339 1184 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 MOSPD3O75425 235 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CCDC130P13994 396 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ZNF18P17022 549 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ANXA13P27216 316 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 INCA1Q0VD86 236 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CUL2Q13617 745 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 NCAPHQ15003 741 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 IQCB1Q15051 598 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TEAD2Q15562 447 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 PTPN21Q16825 1174 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 PARM1Q6UWI2 310 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 GAREM2Q75VX8 874 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 WHAMMQ8TF30 809 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 GDE1Q9NZC3 331 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ATP8B3O60423 1300 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 MYO10Q9HD67 2058 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 F8VP50 259 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TRIM66O15016 1216 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 MICAL2O94851 1124 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 FGF19O95750 216 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 ADORA2BP29275 332 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CACNA2D1P54289 1103 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL3L3-203ENST00000619989 UBXN1Q04323 297 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms