RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 HES6Q96HZ4 224 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 KCNK3O14649 394 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 EXTL3O43909 919 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 FAM189A1O60320 539 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 LILRB3O75022 631 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 GZMAP12544 262 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 CD302Q8IX05 232 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA4DQ92854 862 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 TTPALQ9BTX7 342 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 RAB20Q9NX57 234 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF233A6NK53 670 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 PODXLO00592 558 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 EFEMP2O95967 443 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 IL9P15248 144 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 KCNC3Q14003 757 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 NT5C1BQ96P26 610 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 MED4Q9NPJ6 270 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 H3BQF6 201 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 CLSTN1O94985 981 aa22.83■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 ADH1AP07327 375 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 MYBL2P10244 700 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 TNNC1P63316 161 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 DAAM2Q86T65 1068 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 APOL5Q9BWW9 433 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 AMFRQ9UKV5 643 aa22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 TEX28O15482 410 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 MBTPS2O43462 519 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 RTN2O75298 545 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 SV2AQ7L0J3 742 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 GDF3Q9NR23 364 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 ZMYND10O75800 440 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 MTA2O94776 668 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 EPCAMP16422 314 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 GCNT1Q02742 428 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 CREMQ03060 361 aa22.81■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 RTP2Q5QGT7 225 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 PALB2Q86YC2 1186 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 IFT20Q8IY31 132 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 KAT5Q92993 513 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 I3L4J1 428 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 CHRNB2P17787 502 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 BRCC3P46736 316 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 JADE1Q6IE81 842 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 GPR65Q8IYL9 337 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 BEST2Q8NFU1 509 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 THAP2Q9H0W7 228 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 ASB7Q9H672 318 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.81■■□□□ 1.24
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