RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	OSTM1	Q86WC4	334 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	DNER	Q8NFT8	737 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PJA1	Q8NG27	643 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	RELN	P78509	3460 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	GRM8	O00222	908 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	LRP3	O75074	770 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	AOAH	P28039	575 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ADORA1	P30542	326 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CPT1A	P50416	773 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	JAM2	P57087	298 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	STIL	Q15468	1287 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	STPG1	Q5TH74	334 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CPZ	Q66K79	652 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CES5A	Q6NT32	575 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CPXCR1	Q8N123	301 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF843	Q8N446	348 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TSPYL6	Q8N831	410 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	P2RX5	Q93086	422 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MSL2	Q9HCI7	577 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	WNT16	Q9UBV4	365 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	KLK13	Q9UKR3	277 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768		Q9Y3F1	56 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	LDHC	P07864	332 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CSF2RB	P32927	897 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	LIMK1	P53667	647 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	KCNC3	Q14003	757 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ATP2B3	Q16720	1220 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC184	Q52MB2	194 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	KAZALD1	Q96I82	304 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	STK31	Q9BXU1	1019 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	RAI14	Q9P0K7	980 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO10	Q9UK96	956 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	PLD2	O14939	933 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SHMT1	P34896	483 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MTHFR	P42898	656 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	GSTO1	P78417	241 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	LILRB2	Q8N423	598 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	SEPT8	Q92599	483 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	DLG3	Q92796	817 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	NELL1	Q92832	810 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MLH1-223	ENST00000616768	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.78	□□□□□ -1.48

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