RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614239.1

LHX1-201, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX1, Length 3,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-201ENST00000614239 FGRP09769 529 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 POLR2MP0CAP2 368 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ITGADQ13349 1161 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TLR1Q15399 786 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 NRF1Q16656 503 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 C2CD6Q53TS8 623 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 S100A14Q9HCY8 104 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 K7EPI3 171 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SORBS3O60504 671 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SERPINB7O75635 380 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TMEM253P0C7T8 217 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ARHGAP8P85298 464 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 KCNA1Q09470 495 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ARSHQ5FYA8 562 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TTC25Q96NG3 672 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 NUF2Q9BZD4 464 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.73□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 MT-ND3P03897 115 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 PROCP04070 461 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 EMP3P54852 163 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ACTR3P61158 418 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 VPS72Q15906 364 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 HPS1Q92902 700 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 GINM1Q9NU53 330 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 FUOMA2VDF0 154 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ATP2A1O14983 1001 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ADAM23O75077 832 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 GMNNO75496 209 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 KRT75O95678 551 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TRIM16LQ309B1 348 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 NLRX1Q86UT6 975 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 HELQQ8TDG4 1101 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SNX27Q96L92 541 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 A0A1B0GTW7 788 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 AQP5P55064 265 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 RSPH3Q86UC2 560 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ABCB11O95342 1321 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SPEF2Q9C093 1822 aa14.72□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 FKBP6O75344 327 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 DDHD2O94830 711 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TNFAIP8O95379 198 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SOX5P35711 763 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 FDFT1P37268 417 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 CASP5P51878 434 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 DCAF6Q58WW2 860 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 PERM1Q5SV97 790 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TMC7Q7Z402 723 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SCAIQ8N9R8 606 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 MECRQ9BV79 373 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 CLRN2A0PK11 232 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TM7SF2O76062 418 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LHX1-201ENST00000614239 ARHGAP4P98171 946 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms