RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ECSITQ9BQ95 431 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DRD4P21917 467 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CDC25CP30307 473 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RAD51Q06609 339 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TAB1Q15750 504 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RUBCNLQ9H714 662 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DENND3A2RUS2 1198 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MAP3K13O43283 966 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RAG1P15918 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MYBPC2Q14324 1141 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 BHMTQ93088 406 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GLRA3O75311 464 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KRT34O76011 436 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 UCHL3P15374 230 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OVGP1Q12889 678 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KRT72Q14CN4 511 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 UGP2Q16851 508 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C12orf60Q5U649 245 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NLRP4Q96MN2 994 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM9Q9C026 710 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NEMP1O14524 444 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SORBS3O60504 671 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DGAT1O75907 488 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEA8P43361 318 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ACADSBP45954 432 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GPSM2P81274 684 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CDK16Q00536 496 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 WASHC5Q12768 1159 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 HLFQ16534 295 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OR8H2Q8N162 312 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OXER1Q8TDS5 423 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OTUD5Q96G74 571 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CHID1Q9BWS9 393 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OPLAHO14841 1288 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RIPK2O43353 540 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CYTH3O43739 400 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CD4P01730 458 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GNA15P30679 374 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms