RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 FAM189A1O60320 539 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 PHACTR2O75167 634 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ZMYND10O75800 440 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CLSTN1O94985 981 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 POMCP01189 267 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ADRB2P07550 413 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 P4HA1P13674 534 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 OR1G1P47890 313 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SCNN1GP51170 649 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 VAMP7P51809 220 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 MYL5Q02045 173 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CREMQ03060 361 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 BFSP1Q12934 665 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 MYO1EQ12965 1108 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TRPC3Q13507 836 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA1Q5VX52 437 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TTI2Q6NXR4 508 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 PDXDC1Q6P996 788 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CEP68Q76N32 757 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 RDH13Q8NBN7 331 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 GAB3Q8WWW8 586 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CGRRF1Q99675 332 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 PIDD1Q9HB75 910 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 KLK14Q9P0G3 267 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 FBN2P35556 2912 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TISP43B9A030 160 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 MAN2B1O00754 1011 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TADA2AO75478 443 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 DDHD2O94830 711 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 BMP6P22004 513 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 FCARP24071 287 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TNFSF9P41273 254 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF165P49910 485 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 STX17P56962 302 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 RBP5P82980 135 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 DSC1Q08554 894 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SCAPQ12770 1279 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 BIRC3Q13489 604 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SV2CQ496J9 727 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 JADE1Q6IE81 842 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF843Q8N446 348 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CEP120Q8N960 986 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CRELD1Q96HD1 420 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 FAM81BQ96LP2 452 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ZFP42Q96MM3 310 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TSPY26PQ9H489 355 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CHST7Q9NS84 486 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CITO14578 2027 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ARNTLO00327 626 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 PODXLO00592 558 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 PTGESO14684 152 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 P4HA2O15460 535 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGAP6O43182 974 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 AKAP3O75969 853 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 B3GAT3O94766 335 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 URODP06132 367 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 TPM3P06753 285 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 LRPAP1P30533 357 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 ATICP31939 592 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms