RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 GAB3Q8WWW8 586 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 MYLPFQ96A32 169 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 HPDLQ96IR7 371 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 HHIPQ96QV1 700 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SYT15Q9BQS2 421 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 TMEM206Q9H813 350 aa12.97□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 GCNT4Q9P109 453 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 CKMP06732 381 aa12.96□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa12.96□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 P2RY13Q9BPV8 354 aa12.96□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 ECT2Q9H8V3 914 aa12.96□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 AXIN1O15169 862 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 STX6O43752 255 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 TNNC2P02585 160 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 BDNFP23560 247 aa12.95□□□□□ -0.34
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CTIF-208ENST00000590422 RAP1GAPP47736 663 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 CACNA2D1P54289 1103 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 MYO1EQ12965 1108 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 BECN1Q14457 450 aa12.95□□□□□ -0.34
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CTIF-208ENST00000590422 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 TNMDQ9H2S6 317 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 SMOC1Q9H4F8 434 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 TMEM30AQ9NV96 361 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 CDH9Q9ULB4 789 aa12.95□□□□□ -0.34
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CTIF-208ENST00000590422 CCDC192P0DO97 292 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 DRD1P21728 446 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 CASP1P29466 404 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 IFNAR2P48551 515 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 ASIC1P78348 528 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 CYP27A1Q02318 531 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 KCNB1Q14721 858 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 STK38Q15208 465 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 DUOXA2Q1HG44 320 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 GAB4Q2WGN9 574 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 SHC4Q6S5L8 630 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 WDR49Q8IV35 697 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 ATP2A3Q93084 1043 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 DHX58Q96C10 678 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 PCED1BQ96HM7 432 aa12.94□□□□□ -0.34
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CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 NUP205Q92621 2012 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 DCLK1O15075 740 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 SPTLC2O15270 562 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 ATG13O75143 517 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 CST3P01034 146 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 DLATP10515 647 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 CYP2J2P51589 502 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 FAM26FQ5R3K3 315 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 VSTM1Q6UX27 236 aa12.93□□□□□ -0.34
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