RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 ADRB2P07550 413 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 HDCP19113 662 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 ITPKAP23677 461 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 OPRD1P41143 372 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 ANAPC15P60006 121 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 SCAPQ12770 1279 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.42■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 DEFB119Q8N690 84 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 MYCT1Q8N699 235 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.42■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC6A14Q9UN76 642 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 GPSM3Q9Y4H4 160 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.42■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 NOL4O94818 638 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G4BP0C869 781 aa23.41■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 DUOXA1Q1HG43 343 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 COL28A1Q2UY09 1125 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 CEP76Q8TAP6 659 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 COL26A1Q96A83 441 aa23.41■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.41■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa23.41■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA18Q8TC71 538 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF560Q96MR9 790 aa23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-205ENST00000588780 C2CD2Q9Y426 696 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-205ENST00000588780 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa23.39■■□□□ 1.33
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC12A3P55017 1021 aa23.39■■□□□ 1.33
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CAPNS1-205ENST00000588780 OR2I1PQ8NGU4 316 aa23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-205ENST00000588780 PNMA5Q96PV4 448 aa23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-205ENST00000588780 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC15Q8TF66 581 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-205ENST00000588780 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-205ENST00000588780 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-205ENST00000588780 ACBD6Q9BR61 282 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-205ENST00000588780 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-205ENST00000588780 LEFTY2O00292 366 aa23.36■■□□□ 1.33
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