RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588712.5

NEDD4L-224, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 2,066 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-224	ENST00000588712	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	KRT3	P12035	628 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62	8e-9	■■□□□ 14
NEDD4L-224	ENST00000588712	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-224	ENST00000588712	BRCA2	P51587	3418 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	ATP2C2	O75185	946 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	FBXO21	O94952	628 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	EFEMP2	O95967	443 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CCDC130	P13994	396 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CREM	Q03060	361 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	ACAP1	Q15027	740 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	ARC	Q7LC44	396 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	AP1G2	O75843	785 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	SOD2	P04179	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	MAN1A1	P33908	653 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CLUL1	Q15846	466 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	PKMYT1	Q99640	499 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	COG5	Q9UP83	839 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712		F8W810	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	HCRT	O43612	131 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	SYN1	P17600	705 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-224	ENST00000588712	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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