RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667		M0QYV0	167 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PAPLN	O95428	1278 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GLUD1	P00367	558 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SERPING1	P05155	500 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	NPR3	P17342	541 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	BDNF	P23560	247 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	NRIP1	P48552	1158 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR15	P49685	360 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	BPIFB4	P59827	614 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CDK17	Q00537	523 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	DUSP4	Q13115	394 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CNGA2	Q16280	664 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CHP1	Q99653	195 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667		F8VP50	259 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	LINC01565	O15544	149 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	AP1G2	O75843	785 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	TPM1	P09493	284 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	KLRC2	P26717	231 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	GPD2	P43304	727 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	BCAT1	P54687	386 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	NOMO3	P69849	1222 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	PDE4C	Q08493	712 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	STIL	Q15468	1287 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	TLE6	Q9H808	572 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	C8A	P07357	584 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	PDCL	Q13371	301 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.32	□□□□□ -0.28
DNMT1-208	ENST00000586667	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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