RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTI1O43156 1089 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 CKBP12277 381 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL34P49207 117 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 FNTAP49354 379 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNX16P57768 344 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 DR1Q01658 176 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 RCOR2Q8IZ40 523 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGBD4Q96DM1 585 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 TNIP3Q96KP6 325 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 DPEP3Q9H4B8 488 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYLDQ9NQC7 956 aa29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 GABRDO14764 452 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 LMO2P25791 158 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK7P50613 346 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD52Q8NB46 1076 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAM2Q99965 735 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ESYT3A0FGR9 886 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 INPPL1O15357 1258 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTGIRP43119 386 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB17Q9H0T7 212 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 RSAD1Q9HA92 442 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM49BQ9NUQ9 324 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYB561D2O14569 222 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSMA2P25787 234 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPN7P35236 360 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 COPS2P61201 443 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf53Q5VUE5 145 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PMF1Q6P1K2 205 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLCO2A1Q92959 643 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRPV6Q9H1D0 765 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 NFU1Q9UMS0 254 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 E5RJQ4 531 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 COILP38432 576 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCNN1GP51170 649 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 DRG2P55039 364 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSTM1Q86WC4 334 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM86AQ8N2M4 240 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFT81Q8WYA0 676 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ST7Q9NRC1 585 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM114A2Q9NRY5 505 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PODXLO00592 558 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDGFRBP09619 1106 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCF4P15884 667 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAX3P23760 479 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ECHS1P30084 290 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 CETN2P41208 172 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCAT1P54687 386 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 BST2Q10589 180 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC26Q2I0M4 334 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM60Q495X7 471 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTC27Q6P3X3 843 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERP44Q9BS26 406 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSBPL8Q9BZF1 889 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOMER3Q9NSC5 361 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SSR1P43307 286 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDE4CQ08493 712 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRADDQ15628 312 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 DUPD1Q68J44 220 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 JAMLQ86YT9 394 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SENP8Q96LD8 212 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 RASAL2Q9UJF2 1139 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 HCRTO43612 131 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRCH4O75427 683 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCNN1AP37088 669 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLCNKBP51801 687 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 UPP1Q16831 310 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ECHDC2Q86YB7 292 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM126BQ8IXS8 530 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 MREGQ8N565 214 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLITRK1Q96PX8 696 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 HERPUD2Q9BSE4 406 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACBD3Q9H3P7 528 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 RGS18Q9NS28 235 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 HPCAL4Q9UM19 191 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 C2CD4BA6NLJ0 364 aa29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms