RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSANTD3Q96H12 275 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP8B3O60423 1300 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 H0Y858 1186 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAN2B1O00754 1011 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMA7O14818 248 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-DRAP01903 254 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 BDNFP23560 247 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 AVPR1AP37288 418 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRIK1P39086 918 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLCB2Q00722 1185 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 MON1AQ86VX9 555 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADSSL1Q8N142 457 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAXDC2Q96IV6 333 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf48Q96LL4 319 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRDP23468 1912 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCAM2O15394 837 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT39Q6A163 491 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC93AQ86WB7 457 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAI2Q9GZS0 605 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 NME7Q9Y5B8 376 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 DENND4CQ5VZ89 1909 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS13AQ96RL7 3174 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROB1E7EW31 1015 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARNTLO00327 626 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF12O95522 483 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM49P0CI25 452 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM49CP0CI26 452 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PFKLP17858 780 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP3CCP48454 512 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCLMP48507 274 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE6CP51160 858 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDH8P55286 799 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP3CAQ08209 521 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCO2Q9BYV7 579 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXQ1Q9C009 403 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP3A43Q9HB55 503 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 LTB4R2Q9NPC1 389 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL4A2P08572 1712 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMDP11532 3685 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 OBSL1O75147 1896 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCANO14594 1321 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNE1P24864 410 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASPAP45381 313 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MXI1P50539 228 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE2HP62256 183 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRYBG2Q8N1P7 616 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TDP1Q9NUW8 608 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM170BA6NMN3 283 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 F8VP50 259 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TADA3O75528 432 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP17L7P0C7H9 530 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAP1GAPP47736 663 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 INCA1Q0VD86 236 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNDC8Q6A555 127 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD40Q6AI12 368 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC39CQ8N584 583 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms