RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC3Q9BY71 257 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP8B3O60423 1300 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 F8VP50 259 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAVIN2O95810 425 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF12Q16514 161 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMC8Q8IU68 726 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ING5Q8WYH8 240 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYADMQ96S97 322 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNK16Q96T55 309 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT82Q9NSB4 513 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR2E1Q9Y466 385 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPHA5P54756 1037 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFAP3P55082 362 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD320Q9NPF0 282 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 LGALS16A8MUM7 142 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM66O15016 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 AP1G2O75843 785 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJA1P17302 382 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANXA13P27216 316 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 C8orf48Q96LL4 319 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPY26PQ9H489 355 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 USTQ9Y2C2 406 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 BEST1O76090 585 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALCAP01258 141 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSH1P0DML2 217 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSH2P0DML3 217 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT5P13647 590 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD19P15391 556 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEBPBP17676 345 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLK7P49862 253 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBXN1Q04323 297 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 LEMD2Q8NC56 503 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGF13Q92913 245 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA17Q96L03 361 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMOQ99835 787 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF197O14709 1029 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 MOSPD3O75425 235 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K7CLP57077 242 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJD3Q8N144 294 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM81BQ96LP2 452 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PRU2 124 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM200BP0CF97 657 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GABRR2P28476 465 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF132P52740 706 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPM4P67936 248 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SGO2Q562F6 1265 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 POTEHQ6S545 545 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAREM2Q75VX8 874 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL21Q9HBE4 155 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDH7Q9ULB5 785 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.2■■□□□ 1.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCOR1O75376 2440 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOL4O94818 638 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAEPP09466 180 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 VDRP11473 427 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMP2P13473 410 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP8P40818 1118 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms