RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PALM2	Q8IXS6	379 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RSAD1	Q9HA92	442 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CLUH	O75153	1309 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KRT16	P08779	473 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KRT4	P19013	534 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TREML2	Q5T2D2	321 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	VSIG1	Q86XK7	387 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CPXM1	Q96SM3	734 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	POLI	Q9UNA4	740 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	WDR90	Q96KV7	1748 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TM9SF1	O15321	606 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	P4HA1	P13674	534 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ATIC	P31939	592 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PCK1	P35558	622 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GABRB2	P47870	512 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GDF10	P55107	478 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ATP11A	P98196	1134 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RFX6	Q8HWS3	928 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	EBF2	Q9HAK2	575 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JMZ2	1700 aa		19.29	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	OSTN	P61366	133 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SLC1A5	Q15758	541 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PARP6	Q2NL67	630 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	FYB2	Q5VWT5	728 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF398	Q8TD17	642 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PAFAH2	Q99487	392 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MIS12	Q9H081	205 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPM1	405 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	HMGCR	P04035	888 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MIP	P30301	263 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SSTR1	P30872	391 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RASSF2	P50749	326 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ERP27	Q96DN0	273 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP4	Q96MN2	994 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CDT1	Q9H211	546 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SIX4	Q9UIU6	781 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	USP18	Q9UMW8	372 aa		19.28	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ERBB2	P04626	1255 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL8	P10145	99 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RAP1GAP	P47736	663 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TNFAIP2	Q03169	654 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	INPP5D	Q92835	1189 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CYTH2	Q99418	400 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		19.27	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HBP1	O60381	514 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CILP	O75339	1184 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	BANF1	O75531	89 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG6	O75602	509 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	WFS1	O76024	890 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A27	O95847	323 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	RBP3	P10745	1247 aa		19.27	■□□□□ 0.67

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