RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	YAF2	Q8IY57	180 aa		23.25	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		23.25	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		23.25	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA17	Q96L03	361 aa		23.25	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		23.25	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		23.25	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		23.25	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	DPYSL4	O14531	572 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP3	O75969	853 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	NR2F2	P24468	414 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP27A1	Q02318	531 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF699	Q32M78	642 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL26	Q9Y258	94 aa		23.24	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	23.23	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	PNOC	Q13519	176 aa		23.23	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	23.23	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		23.23	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MXQ7	604 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAM2	O15394	837 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GFRA3	O60609	400 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	AVPR1A	P37288	418 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH8	P55286	799 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA20	Q8TB22	786 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM3C	Q92520	227 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf48	Q96LL4	319 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SDCBP2	Q9H190	292 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		23.22	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SP9	P0CG40	484 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIK1	P39086	918 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	VAMP7	P51809	220 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA2D1	P54289	1103 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCB2	Q00722	1185 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ENPEP	Q07075	957 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM9	Q13443	819 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	RIN3	Q8TB24	985 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MSANTD3	Q96H12	275 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	TDP1	Q9NUW8	608 aa		23.21	■■□□□ 1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR23A	A6NEV1	266 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNE1	P24864	410 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RAP1GAP	P47736	663 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX9	P48436	509 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	USP46	P62068	366 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF4B	Q92750	862 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A12	Q96S37	553 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	GCNT4	Q9P109	453 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		23.2	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200		F8VP50	259 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM66	O15016	1216 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TNK2	Q07912	1038 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP3CA	Q08209	521 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TIGD1	Q96MW7	591 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	GSDMA	Q96QA5	445 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		23.19	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DRA	P01903	254 aa		23.18	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM49	P0CI25	452 aa		23.18	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM49C	P0CI26	452 aa		23.18	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNB1	P11230	501 aa		23.18	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA13	P27216	316 aa		23.18	■■□□□ 1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CTH	P32929	405 aa		23.18	■■□□□ 1.3

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