RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 FUKQ8N0W3 1084 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ITFG1Q8TB96 612 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR152Q8TDT2 470 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 GIPC2Q8TF65 315 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA17Q96L03 361 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CDH7Q9ULB5 785 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 F8VP50 259 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CLDN5O00501 218 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 MICAL2O94851 1124 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF18P17022 549 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 RAD23BP54727 409 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 RRAGAQ7L523 313 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 UBR7Q8N806 425 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 C12orf29Q8N999 325 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ING5Q8WYH8 240 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 FGF13Q92913 245 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 C8orf48Q96LL4 319 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 GCNAQ96QF7 691 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 MYADMQ96S97 322 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC3Q9BY71 257 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CD320Q9NPF0 282 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 BECN2A8MW95 431 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 AP1G2O75843 785 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 NOL4O94818 638 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM200BP0CF97 657 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 LAMP2P13473 410 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CEBPBP17676 345 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC9A1P19634 815 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 PON1P27169 355 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC25CP30307 473 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CCR2P41597 374 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM270Q6UE05 265 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 GDE1Q9NZC3 331 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 EHD2Q9NZN4 543 aa20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 GABRR2P28476 465 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ADORA2BP29275 332 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CACNA2D1P54289 1103 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 MFAP3P55082 362 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 GAREM2Q75VX8 874 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 STKLD1Q8NE28 680 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 KAT5Q92993 513 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 MYRFLQ96LU7 910 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 VPS16Q9H269 839 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PRU2 124 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 PAEPP09466 180 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 CD19P15391 556 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 MTMR3Q13615 1198 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF135Q8IUD6 432 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 IL21Q9HBE4 155 aa20.01■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 LGALS16A8MUM7 142 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFRSF10AO00220 468 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 RFX1P22670 979 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 TPM4P67936 248 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 IQCB1Q15051 598 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 TEAD2Q15562 447 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 SGO2Q562F6 1265 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 MTSS1LQ765P7 747 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNK16Q96T55 309 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms