RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843		A1L4Q6	167 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ARIH2	O95376	493 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	MYBL2	P10244	700 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PRF1	P14222	555 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	RENBP	P51606	427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	LILRA4	P59901	499 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	FZD9	O00144	591 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	DSCR3	O14972	297 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	IGSF3	O75054	1194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	THBS3	P49746	956 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TWIST1	Q15672	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ERC2	O15083	957 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	OAZ2	O95190	189 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	AHSG	P02765	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	NOG	Q13253	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65	2e-9	■■■□□ 18.3
COPS2-205	ENST00000558843	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	CUL5	Q93034	780 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ALPL	P05186	524 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	FPR3	P25089	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	KRT85	P78386	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ABLIM3	O94929	683 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	HTR6	P50406	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	HK3	P52790	923 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	GHRHR	Q02643	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	E2F2	Q14209	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	IQCB1	Q15051	598 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	SLC16A6	O15403	523 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	KCNJ5	P48544	419 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ITK	Q08881	620 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COPS2-205	ENST00000558843	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	A1BG	P04217	495 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	TYR	P14679	529 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	PDE6C	P51160	858 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66

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