RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557355.1

LINC01146-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1146, human

TSL 4 BASIC

Gene LINC01146, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01146-208	ENST00000557355	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	ATP10A	O60312	1499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	ABCC3	O15438	1527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	ADGRB3	O60242	1522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	BRINP1	O60477	761 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	ITGAL	P20701	1170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SCP2	P22307	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	CD6	P30203	668 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	TWIST1	Q15672	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	A2M	P01023	1474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	AGXT	P21549	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	RAB39A	Q14964	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SYNM	O15061	1565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SGTA	O43765	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	CYP4F2	P78329	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	NUP155	O75694	1391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINC01146-208	ENST00000557355	PPM1D	O15297	605 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	OAZ2	O95190	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PDHA1	P08559	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	UBR7	Q8N806	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	AGL	P35573	1532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PPL	O60437	1756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KIF1B	O60333	1816 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PTPRT	O14522	1441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CHEK2	O96017	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	THBS3	P49746	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TLE1	Q04724	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	RITA1	Q96K30	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MYOM2	P54296	1465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TLR5	O60602	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ALPL	P05186	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ENG	P17813	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CHRM3	P20309	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms